I think you should do as your boss asked.
あなたは上司の言ったとおりにすべきだと思います。
as には「～するように」「～のやり方で」という意味もあります。
同類の表現
Do to others as you would have others do to you.
あなたが人にしてもらいたいと思うことを人にしてあげなさい。
You can carry out this plan as you like.
あなたは自分の気に入るようにこの計画を実行してよい。
Give up smoking as your doctor advised.
お医者様が勧めたように禁煙しなさい。
You must do it just as I do it.
私がやるとおりに、君はそれをしないといけない。
You may dance as you please.
好きなように踊っていいよ。